Por forma a criar uma relação de equilíbrio entre tradição e inovação, os elementos novos ganham materialidades distintas de acordo com o tipo de peça a exibir: A rampa é executada em estrutura de ferro, folheada a chapa metálica e pintada na cor branca. É desenhada de forma modular e acomoda um extenso número de bengalas (com uma superfície expositiva de, aproximadamente, 45 m lineares). A sua modularidade facilita igualmente a sua instalação no interior do edifício; Por contraste, o braço exterior suspenso que alberga as pinturas sobre marfim ganha no seu interior a cor escura, espaço em penumbra, de cariz intimista, que nos faz deter sobre o detalhe das pequenas peças em exposição; O espaço de logradouro e a nave, por seu turno, recuperam os materiais típicos das construções algarvias: pavimento em ladrilhos de terracota, paredes caiadas de branco, telha de canudo na cobertura principal da nave.

A porta de acesso ao museu – executada em madeira e pintada na cor sangue-de-boi – replica o modelo original da porta anteriormente existente. Por fim, a estratégia de iluminação visou potenciar as características próprias do espaço nomeadamente a de um certo dramatismo imanente à sua condição original de espaço de culto. No que respeita à iluminação natural, a manipulação desta condição, concretizou-se através de aberturas pontuais que fazem contrastar espaços fortemente iluminados com outros em penumbra. No caso da iluminação artificial, todo o esforço se centrou na iluminação pontual das peças e objetos expostos em oposição ao espaço geral de iluminação mais homogénea e de menor intensidade.